超聲波細胞破碎儀是利用超聲波在液體中的分散效應(yīng),使液體產(chǎn)生空化的作用,從而使液體中的固體顆粒或細胞組織破碎。常規(guī)使用方法是把要破碎的材料放到燒杯中，開電源設(shè)定時間（震動時間和間歇時間），將破碎儀的探頭放到材料中。使用過程中，超聲波發(fā)生器電路將50/60Hz的市電轉(zhuǎn)換成18-21KHz的高頻高壓電能，因此破碎過程中會大量產(chǎn)熱，一般在冰浴（鹽水蓄熱量更好，一般建議選擇飽和鹽水）下破碎。

超聲波細胞破碎儀的功率大小是常見的指標，它決定著被破碎物的數(shù)量、大小、質(zhì)量及效果。所以各生產(chǎn)廠家對此指標也都非常重視。一般情況下，實驗室、化驗室、研究所、藥品檢驗所等科研單位，使用的功率都不大，（一般在500W以下）；而生物公司、制藥廠、化工企業(yè)等生產(chǎn)單位，所用的功率大都在500W-2000W左右。由于各制造廠家的產(chǎn)品結(jié)構(gòu)不同，其功率的標注方法也不盡相同。不過按照用戶常用的慣例，一般有以下幾種：50W、100W、150W、250W、300W、350W、500W、1000W、2000W。一般超聲波細胞破碎儀輸出功率可根據(jù)需要適度調(diào)節(jié)。

標準超聲波細胞粉碎機產(chǎn)品的額定工作頻率是20千赫茲。一些超聲波細胞粉碎機有自動調(diào)諧功能可以使頻率在一個小的范圍內(nèi)變化。